Cohort Profile: Investigating Antidepressant Response within Generation Scotland
この論文は、スコットランドの「Generation Scotland」コホートを用いて、抗うつ薬への反応に関する詳細な質問票データを収集し、臨床記録との照合および生物学的サンプルの分析を通じて、抗うつ薬の反応性における個人差の生物学的メカニズムを解明する「AMBER」研究プログラムのコホートプロファイルを示しています。
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genetic and genomic medicine
126 件の論文
遺伝子とゲノム医学は、私たちの体の設計図であるDNAを読み解き、病気の原因や治療法を探る最先端の分野です。この領域では、個人に合わせた医療や新たな薬の開発が急速に進んでおり、未来の健康管理の形を大きく変えようとしています。
Gist.Scienceでは、medRxivから投稿されるこの分野のすべての最新プレプリントを扱っています。専門的な論文を誰にでもわかる平易な言葉で要約すると同時に、研究者向けの技術的な詳細も併せて提供し、科学的な知見へのアクセスを democratize することを目指しています。
以下に、medRxivから最新に追加された遺伝子およびゲノム医学に関する研究論文の一覧を掲載します。
Saturation genome editing of BARD1 resolves VUS and provides insight into BRCA1-BARD1 tumor suppression
本研究は、BARD1 遺伝子の全コード領域を対象とした飽和ゲノム編集により、約 11,000 種類の遺伝子変異の機能的影響を網羅的に評価し、既存の意義不明変異（VUS）の 95.4% を臨床的に解明するとともに、BARD1 が BRCA1 との複合体を介してゲノム安定性を維持し腫瘍抑制に不可欠であることを示しました。
Phenotypic and transcriptomic characterisation of a novel biallelic RNU2-2 developmental and epileptic encephalopathy
本研究は、保存された 5 領域にクラスター化する 12 の超希少な二対性 RNU2-2 変異が、重度の発達性てんかん性脳症（DEE）という新たな疾患原因であることを、深い表現型解析と線維芽細胞を用いたトランスクリプトーム解析によって実証し、将来の変異検証法として線維芽細胞での RNA シーケンシングを提案しています。
A time-to-event heritability framework for inferring the genetic architecture of longitudinal traits
本研究は、縦断データに基づく時間至イベント（TTE）形質の遺伝率を推定するための新しい Cox 比例ハザード混合モデル「COXMM」を提案し、従来の手法では過小評価されていた TTE 遺伝率の正確な推定と、疾患の進行や遺伝的構造の解明に寄与する枠組みを提供するものである。
Contribution of dominant and recessive model effects to the genetic architecture of Idiopathic Pulmonary Fibrosis
この研究は、特発性肺線維症（IPF）の遺伝的基盤を解明するため、従来の相加モデルに代わって優性・劣性モデルを用いたゲノムワイド関連解析を実施し、PMF1 や EPN3 といった新規の遺伝子シグナルを同定することで、IPF の病態理解と治療法開発への新たな示唆を提供した。
Genome-wide association studies to identify shared and distinct mechanisms of fibrosis across 12 organ-systems
この論文は、英国バイオバンクのデータを用いたゲノムワイド関連解析により、12 の臓器系にわたる線維症の共通および特異的な遺伝的メカニズムを解明し、複数の臓器にまたがる新たな遺伝的リスク因子や遺伝的相関を同定したことを報告しています。
Investigating penetrance of severe combined immunodeficiency variants in an adult population cohort: implications for genomic newborn screening
英国バイオバンクの全ゲノム配列データを用いた大規模コホート研究により、重症複合免疫不全症（SCID）の遺伝子変異の浸透率が極めて低いことが示され、新生児ゲノムスクリーニングへの組み込みは依然として有望であるが、低浸透率変異の報告には注意が必要であることが結論付けられました。
Distinguishing causal from tagging enhancers using single-cell multiome data
本研究は、単細胞マルチオミクスデータを用いたエンハンサーと標的遺伝子の関連付けにおいて、共アクセス性に基づく相関が非因果的なタグ付け効果として広範に存在することを示し、これを考慮した統計的手法（SuSiE によるファインマッピングなど）を用いることで、CRISPRi や eQTL データに基づく真の因果関係の同定精度が大幅に向上することを明らかにしました。
Three Sibling Genes Involved in Genetic Risk for Lateral Epicondylopathy
英国バイオバンクのデータを用いたゲノムワイド関連解析により、外側上顆炎の遺伝的リスク因子として、細胞外マトリックスのリモデリングに関与する SIBLING 遺伝子群（IBSP、MEPE、SPP1）を含む 2 つの遺伝子座が初めて同定されました。
Phylo-Plex: A phylogenetically informed, low-cost amplicon sequencing platform for deployable high-resolution genomic epidemiology
低資源環境でも展開可能な低コストな「Phylo-Plex」と呼ばれる新規アンプリコンシーケンシングプラットフォームが開発され、トレポネマ・パリーダムや淋菌などの病原体に対して、全ゲノムシーケンシングに匹敵する高分解能な系統追跡を可能にすることが示されました。